محمد محمد اللیثی در سال ۱۹۵۲ میلادی در روستای نخاس از توابع شهر زقازیق در استان شرقی مصر به دنیا آمد و در خانواده‌ای قرآنی رشد و تربیت یافت. پدرش محمد ابوالعلا، تنها فردی بود که در روستا توانسته بود کل قرآن کریم را حفظ کند و این امر انگیزه‌ای برای تربیت فرزندش در دنیای قرآن شد. از همان ابتدا، محمد تحت تعلیم پدر خود شروع به حفظ قرآن کریم کرد و توانست در سن سه سالگی کل قرآن را حفظ کند. این استعداد خاص او در حفظ قرآن باعث شد که در سنین کودکی، مفاهیم قرآن را به خوبی درک کرده و ارتباط عمیقی با آیات وحی برقرار نماید.

با توجه به علاقه روزافزون محمد به تلاوت قرآن، او در سن شش سالگی فنون تلاوت قرآن کریم را نیز به طور کامل و تحت تعلیم پدرش فرا گرفت. این علاقه‌مندی باعث شد که محمد به تقلید از تلاوت‌های بزرگانی چون عبدالباسط محمد عبدالصمد، مصطفی اسماعیل، محمد رفعت، کامل یوسف بهتیمی و سعید عبدالصمد الزناتی بپردازد.

نوشته تلاوت مجلسی سوره نبأ و سوره نازعات و سوره انفطار محمد اللیثی اولین بار در مشکات. پدیدار شد.